Do zakresu działania Referatu Organizacyjnego (KM-06) należą sprawy:
1) prowadzenia Sekretariatu i obsługi administracyjno-biurowej Wydziału, obsługi systemu EZD PUW raz elektronicznej skrzynki pocztowej Wydziału;
2) opracowywania wniosków do projektu budżetu Miasta w układzie zadań budżetowych, wprowadzania projektów planów budżetu oraz Mierników i Wskaźników do systemu informatycznego, sporządzania sprawozdań oraz koordynacja i nadzór nad realizacją budżetu Wydziału, według zadań i klasyfikacji budżetowej;
3) sporządzania harmonogramu wydatków, dokonywania korekt oraz nadzór nad realizacją poszczególnych zadań;
4) koordynowania prac dotyczących monitorowania czasu pracy dla potrzeb analizy pracy Wydziału;
5) prowadzenia ewidencji rachunków, faktur i umów, obsługa podsystemów GRU, WYBUD i WPBUD;
6) przygotowywania dokumentacji oraz projektów umów dotyczących zlecania wykonania zadań innym podmiotom w tym w trybie ustawy o zamówieniach publicznych;
7) opracowywania planów zamówień publicznych Wydziału oraz obsługi aplikacji SOZP;
8) sporządzania analiz statystycznych w zakresie działania Wydziału;
9) opracowywania projektów zarządzeń i pism okólnych Prezydenta oraz sporządzania informacji o ich wykonaniu;
10) opracowywania informacji o realizacji poleceń służbowych Prezydenta i Dyrektora Magistratu;
11) opracowywania projektów zarządzeń wewnętrznych, poleceń służbowych i pism okólnych Dyrektora Wydziału oraz kontroli ich wykonania;
12) opracowywania projektów upoważnień i pełnomocnictw Prezydenta. Prowadzenia i aktualizacji wydziałowego rejestru udzielonych przez Prezydenta Miasta Krakowa upoważnień i pełnomocnictw;
13) koordynacji przygotowywania projektów kart usług/instrukcji postępowania określających tryb załatwiania spraw należących do kompetencji Wydziału. Prowadzenia rejestru kart usług/instrukcji postępowania Wydziału;
14) prowadzenia księgi inwentarzowej środków trwałych dla wszystkich lokalizacji Wydziału oraz pozostałych środków dla lokalizacji określonej przez Dyrektora Wydziału lub osobę upoważnioną;
15) prowadzenia ewidencji sprzętu użyczonego dla realizacji zadań w zakresie wydawania uprawnień do kierowania pojazdami oraz rejestracji pojazdów. Przeprowadzenia inwentaryzacji sprzętu użyczonego;
16) prowadzenia wydziałowego rejestru wniosków, interpelacji oraz postulatów posłów i senatorów dotyczących zadań Wydziału;
17) sporządzania zamówień na materiały biurowe, wyposażenie - poprzez internetowy system zamówień (ESZT), druki, środki trwałe, sprzęt oraz bilety komunikacji miejskiej. Nadzór nad ich prawidłowym wykorzystaniem;
18) prowadzenia stanu zatrudnienia Wydziału;
19) załatwiania bieżących spraw kadrowych i socjalnych pracowników oraz prowadzenia ewidencji kart badań okresowych i terminowości ich wykonywania;
20) prowadzenia spraw osobowych pracowników Wydziału tj. zakresy czynności, listy obecności, książka wyjść służbowych, rejestracja krajowych wyjazdów służbowych;
21) prowadzenia książki wyjść prywatnych oraz rejestru godzin nadliczbowych dla pracowników referatu organizacyjnego;
22) sporządzania wniosków o wypłatę stałych i zmiennych składników wynagrodzeń;
23) Przygotowania dokumentacji celem naboru na wolne stanowiska urzędnicze i kierownicze w Wydziale;
24) prowadzenia wydziałowego rejestru pieczęci urzędowych;
25) współpracy z Pełnomocnikiem Prezydenta Miasta Krakowa ds. Systemu Zarządzania Jakością według wymagań normy ISO 9001 oraz ISO 27001, realizacja zadań w tym zakresie;
26) przygotowywania materiałów i informacji prasowych, współpraca z komórką organizacyjną właściwą ds. kontaktów z mediami;
27) koordynacji zadań dotyczących weryfikacji i opracowywania danych do publikowania w Biuletynie Informacji Publicznej oraz Miejskiej Platformie Internetowej Magiczny Kraków (MPI), nadzór nad kompletnością informacji i aktualnością danych, dbałość o zapewnienie informacji wizualnej dla stron;
28) sporządzania projektów upoważnień do przetwarzania danych osobowych do pracy w zbiorach danych zgodnie z Polityką Bezpieczeństwa Informacji, obsługa aplikacji SEZAM. Monitorowanie stosowania Polityki Bezpieczeństwa Informacji;
29) prowadzenia działań zmierzających do doskonalenia organizacji pracy Wydziału (zapewnienie sprawnego systemu informacyjnego, racjonalizacji obiegu dokumentów);
30) prowadzenia postępowań skargowych;
31) prowadzenia rejestru wniosków o udzielonych informacjach publicznych.