Na czele KEGW stoi Dyrektor, który kieruje jednostką i ponosi pełną odpowiedzialność za całokształt jej pracy oraz osiągnięte przez tę jednostkę wyniki.
1. Szczegółowy zakres działania KEGW określa regulamin organizacyjny.
2. Schemat organizacyjny jednostki Klimat-Energia-Gospodarka Wodna.